Všechna nastavení pro BIND se provádějí v souboru /etc/named.conf. Nicméně data pro zóny, jako názvy počítačů, IP adresy atd. jsou uloženy v separátních souborech v adresáři /var/lib/named. Bližší informace jsou uvedeny v následujícím textu.

Konfigurační soubor /etc/named.conf se dělí na dvě oblasti. Obecná nastavení jsou v části options, v části zone jsou položky pro jednotlivé domény. Kromě toho je zde volitelně také oblast logging a položky typu acl (Access Control List). Komentáře začínají znakem # či znaky //. Minimalistický /etc/named.conf je uveden v příkladu 20.2 – „Jednoduché nastavení souboru /etc/named.conf“.

options { 
        directory "/var/lib/named"; 
        forwarders { 10.0.0.1; };
        notify no;
};

zone "localhost" in {
       type master;
       file "localhost.zone";
};

zone "0.0.127.in-addr.arpa" in {
        type master;
        file "127.0.0.zone";
};

zone "." in {
        type hint;
        file "root.hint";
};